Statistisches Modell & Auswertung

 

Specify a model  

 

 

Nach Beendigung des Preprocessing muss nun das statischtische Modell definiert werden. Eingang in diese Definition finden Paradigmenparameter wie Interscaninterval. Anzahl der Bilder pro Messung, Anzahl der Trails, Anzahl der Bilder je Trail etc..

 

Anhand des nachfolgendes Beispiel soll die Erstellung des Modells dargestellt werden:

 

*          fMRI Messung mit 45 Bildern / Messung

*          Interscanninterval:  8sec

*          Blockdesignparadigma mit 4 ON und  5 OFF, Phasen, alternierend

*          je 5 Bilder pro ON/OFF Phase

*          ein Trail, d.h. nur die ON Phasen werde gewertet, die OFF-Phasen sind Ruhe Phasen - wenn in der Ruhe (OFF) Handlungen ausgeführt werden (z.B. Fixieren einer optischen Figur) kann man die OFF-Phase als eigenen Trail definieren um nacher die Trails voneinander abziehen zu können

 

 
 

 

 

 

 

 

 

 


Achtung, die Ergebnisfiles werden in den folgendenden Schritten nicht automatische zu den bearbeiteten Datensätzen dazugeschrieben, sondern in das aktuelle Working-directory geschrieben à entsprechendes Directory auswählen!

 

 

fMRI – models     anklicken

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

what would you like to do :  Specify a model

 

interscan interval:                         8  (Zeit zwischen 2 Scans in sec)

scans per session :                     45  (Anzahl der Bilder je Messung)

Nr. of conditions or trail :             1 (Anzahl der Trails bzw. Testkonditionen)   

select number of conditions :     trail 1 (Name für Taril z.B. Fingertippen ON)

 

stocastic design :                        no (ist in dem Design vom Zufall abhängig?)

SOA (scans of asynchronie) :    fixed (ist das Design fix bzw. symetrisch – gleiche Phasen, -längen, -bilderanzahl etc.?)

SOA (scans of as for trail 1) :     10 (Anzahl der Scans zwischen dem ersten Beginn von Trail 1bis zum nächsten Beginn des Trails)

Time for first trail (scan) :            5 (wann beginnt der erste Taril? – in Anzahl der Scans rechnen, erstes Bild zählt als 0)

 

Parametric modulation :             none

are these trail :                             epochs (à Block-Design)

select type of response :             box car

convolve with hrf :                         yes (Zeitlich Ableitung der hämodynamic Response Funktion)

add temporal derivate :               no

epoch length :                               5 (Anzahl der Bilder je Epoche/Phase)

interaction among trails :            no (interagieren die Trails?)

user specified regressor :          0 

 

Diagramme erscheinen

                                                      

SPM_fMRIDesMtx.mat wird im aktuellen Working-directory angelegt

 

 

Estimate

 

 


fMRI – models     anklicken

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

what would you like to do: Estimate a specifed model

 

 

 

Fenster öffnet sich :

 

 

*  SPM_FMRiDesMtx.mat anklicken

 

*  Done anklicken

 

 
 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Fenster öffnet sich :

 

 

*  alle snrs-4...img anklicken

 

*  Done anklicken

 

 
 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Remove global effects :                  no

            High pass filter :                               specify

            Session ... period :                           175  (Vorgabe annehmen)

            Low pass filter :                                HRF

            Model intrinsic correlation :             none

         Setup trial-specific F-contrast :      yes

         Estimate : now

 

 

 

               Säule erscheintwarten

 

 

 

SPM.mat wird im aktuellen Working-directory angelegt

 

 

 

Results

 

 

Results     anklicken

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Fenster öffnet sich :   

 

 

*  SPM.mat anklicken

 

*  Done anklicken

 

 
 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Fenster öffnet sich :

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Fenster öffnet sich :

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Contrast: in dem Beispiel wurde ein Trail definiert, dieser wird mit 1 belegt, die Off-Phase mit 0.

Hätte man mit 2 Trails gearbeitet und wollte diese nun von einander abziehen, so würde man einem Trail die 1 zuweisen und dem Trail, der davon abgezogen werden soll, eine –1. Zur Begutachtung der einzelnen Trails würde man 1 0 bzw. 0 1 eingeben (mit Leerzeichen dazwischen!), um Aussagen über die einzelnen Trails machen zu können.  

 

 

Fenster öffnet sich :   

 

*  Den entsprechende Contrast aus der Liste anwählen

z.B. con1

 

*  Done    anklicken

 
 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


                                   Mask with other contrasts : no

                                   title for comparsion :            con1

                       

 

                       Säule erscheintwarten

 

 

                                   Corrected height treshold : no (no = uncorrected; yes = corrected)

                                   Treshold (T or p value):        0,001

                                   Extent treshold voxel :          0

 

 

 

Fenster öffnen sich :

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Verschiedene Möglichkeiten der Darstellung der Ergebnisse

 

 

Ø  Anzeige der Signifikanzwertetabelle

 

 


Volume anklicken

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Ø Darstellung der Ergebnisse auf einem Standart-Gehirn

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


             render auswählen               Fenster öffnen sich :

 

 

 
 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


3 Auswahlmöglichkeiten:

 

1.      render_singel_subj.mat

2.      render_smooth_average.mat

3.      render_spm96.mat

 

 

 

            1. render_singel_subj.mat :

 

 
 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


           

 

 

2 . render_smooth_average.mat :

 

 

 
 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


            3.  render_spm96.mat

 

 

 
 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Ø Darstellung der Ergebnisse auf einem individuellen Gehirn – Schnittbilder

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


slices auswählen ê:  dann den coregistrierten und normalisierten 3D-Datensatz des

             entsprechenden Probanden anklicken, z.B. 4.- img

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


sections auswählen ì : dann den coregistrierten und normalisierten 3D-Datensatz

     des  entsprechenden Probanden anklicken, z.B. 4.- img

 

*  Durch verschieben des roten Pfeils im Glasbrain, durch Anklicken mit der Maus, kann man durch die einzelnen Schnittbilder scrolen. Ein andere Möglichkeit ist die direkte Eingabe der Koordinaten in das Result-Fenster í.